Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPATA16Q9BXB7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms