Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms