Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms