Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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