Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms