Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGLYRP2Q96PD5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms