Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms