Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms