Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms