Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTV1Q96GA3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms