Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms