Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms