Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms