Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms