Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EDAQ92838 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms