Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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