Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM41Q8WV44 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms