Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP1Q8TDR0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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