Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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