Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CSNK2A3Q8NEV1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CSNK2A3Q8NEV1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CSNK2A3Q8NEV1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CSNK2A3Q8NEV1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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