Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms