Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms