Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms