Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms