Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms