Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC9A4Q6AI14 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms