Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms