Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG9BQ674R7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms