Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms