Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
C5orf47Q569G3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 PLAT-204ENST00000429710 1655 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 PRLR-211ENST00000511486 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C5orf47Q569G3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms