Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms