Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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