Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms