Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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