Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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