Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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