Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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