Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms