Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms