Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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