Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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