Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms