Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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