Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
APOFQ13790 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms