Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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