Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
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