Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGCGQ13326 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGCGQ13326 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGCGQ13326 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SGCGQ13326 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SGCGQ13326 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SGCGQ13326 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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