Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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