Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms