Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms